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Les bactéries intestinales pourraient expliquer pourquoi le sepsis est plus grave chez certains patients

Une étude publiée dans Nature chez la souris a trouvé que des microbes intestinaux précis étaient associés à une inflammation plus forte et à une survie moindre, mais des experts mettent en garde : ces résultats ne peuvent pas encore être appliqués directement aux humains

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Les bactéries intestinales pourraient expliquer pourquoi le sepsis est plus grave chez certains patients
De nouvelles recherches chez la souris lient des différences du microbiome intestinal à la gravité du sepsis, renforçant l'hypothèse que la santé intestinale peut influencer la réponse immunitaire à une infection.
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De nouvelles recherches chez la souris lient des différences du microbiome intestinal à la gravité du sepsis, renforçant l'hypothèse que la santé intestinale peut influencer la réponse immunitaire à une infection.

Des différences dans le microbiome intestinal pourraient aider à expliquer pourquoi le sepsis devient beaucoup plus dangereux dans certains cas que dans d'autres, selon une nouvelle étude publiée dans Nature qui a trouvé que certaines bactéries intestinales aggravaient les résultats chez des modèles murins.

La recherche, menée par des scientifiques du Infectious Disease Research Center du Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, a examiné des souris femelles génétiquement similaires présentant des microbiomes intestinaux différents. Les souris ont été infectées par Acinetobacter baumannii, une bactérie résistante qui peut conduire au sepsis.

Le sepsis est une réaction potentiellement mortelle à une infection, et les résultats peuvent varier fortement même lorsque l'infection semble similaire. Les nouvelles observations suggèrent que la composition du microbiome intestinal peut influencer l'intensité de la réponse immunitaire avant même qu'une infection ne s'installe. Les preuves, toutefois, proviennent de recherches animales, et un spécialiste externe des maladies infectieuses a mis en garde : il faudra davantage de travail avant de tirer des conclusions pour les patients humains.

Les chercheurs ont comparé des souris ayant des taux de survie plus élevés à des souris ayant des taux plus faibles, en examinant les bactéries intestinales, les niveaux bactériens dans le sang et les organes, et des marqueurs cellulaires. Les souris avec une moins bonne survie présentaient une part beaucoup plus élevée de bactéries Muribaculaceae dans l'intestin — environ 28 % du microbiome dans une comparaison, contre 0,15 % chez les souris qui survivaient à un taux plus élevé.

Ces souris plus vulnérables ont montré une réponse inflammatoire précoce et intense et, plus tard, une plus grande présence de bactéries dans le sang, les poumons et la rate. Une souche bactérienne, Sangeribacter muris KT1-3, s'est distinguée chez les souris ayant une survie plus faible. Lorsque des souris qui avaient normalement un taux de survie élevé ont été hébergées avec des souris porteuses de KT1-3, leur survie est tombée à 10 %, selon les résultats rapportés.

Andrew Fleming, chef de la section maladies infectieuses et immunologie au NYU Langone Hospital, Brooklyn, qui n'a pas participé à l'étude, a déclaré que les scientifiques savent depuis longtemps que les bactéries intestinales et les toxines bactériennes peuvent pénétrer dans le sang pendant un sepsis et intensifier l'inflammation. « Ce processus est particulièrement important dans le choc septique, où la paroi intestinale devient plus perméable à la translocation (ou fuite) de produits bactériens », a déclaré Fleming.

Fleming a dit qu'il existe de plus en plus de preuves qu'un microbiome intestinal diversifié et sain peut être protecteur en partie contre un sepsis sévère, tandis qu'un microbiome perturbé — notamment par des antibiotiques — peut altérer la réponse immunitaire. Il a également noté que les antibiotiques peuvent avoir des effets majeurs et durables sur le microbiome, et a cité des estimations du CDC selon lesquelles jusqu'à 80 % des adultes américains reçoivent un antibiotique chaque année, dont environ 30 % sont considérés comme inutiles.

Les limites de l'étude sont importantes. Fleming a dit que Sangeribacter muris n'est pas typiquement trouvée chez l'humain, ce qui signifie que le mécanisme montré dans l'étude murine ne peut pas être appliqué directement aux personnes. Il a qualifié les résultats de point de départ intrigant et a dit que des essais cliniques bien conçus sont nécessaires pour déterminer si des effets similaires du microbiome influencent la gravité du sepsis chez l'humain.

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